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CS 594 — Algorithmische Bioinformatik
(engl. Algorithms in Bioinformatics)

Niveaustufe, VerpflichtungsgradVertiefungsmodul, Wahlpflichtmodul
Lehr- und Lernformen,
Arbeitsaufwand
Vorlesung (2 SWS), Übung (2 SWS),
180 Stunden (60 Std. Präsenzzeit, 120 Std. Selbststudium)
Leistungspunkte,
Voraussetzungen zum Erwerb
6 LP
Studienleistung: Erreichen von mindestens 50 Prozent der Punkte aus den wöchentlich zu bearbeitenden Übungsaufgaben und mündliche Präsentation der Lösung von mindestens zwei der Übungsaufgaben.
Prüfungsleistung: Klausur oder mündliche Prüfung
Sprache,
Benotung
Deutsch,
Die Benotung erfolgt mit 0 bis 15 Punkten gemäß der Prüfungsordnung für den Studiengang M.Sc. Informatik.
Dauer des Moduls,
Häufigkeit
Ein Semester,
Regelmäßig alle 2 Semester
Modulverantwortliche(r)Prof. Dr. Alfred Ultsch

Inhalt

  • Biologische Grundlagen
  • DNA-Analyse und Gen-Detektion
  • Microarray Techniken und -Analyse
  • Visualisierung und Dimensionsreduktion
  • Gene Ontologien
  • Überrepräsentationsanalyse
  • Micro-RNAs und ihre Funktionen
  • Wissensentdeckung in biologischen Wissensbasen

Qualifikationsziele

Die Studierenden sollen

  • grundlegende Fragestellungen und Ziele in der Bioinformatik verstehen,
  • grundlegende Konzepte der Modellierung von DNA und Proteinen kennen,
  • Kenntnisse zu algorithmischen Grundlagen bioinformatischer Anwendungen erwerben,
  • Methoden der Wissensentdeckung in Biologischen Datenbanken verstehen und anwenden können,
  • wissenschaftlicher Arbeitsweisen einüben (Erkennen, Formulieren, Lösen von Problemen, Schulung des Abstraktionsvermögens),
  • mündliche Kommunikationsfähigkeit in den Übungen durch Einüben der freien Rede vor einem Publikum trainieren.

Voraussetzungen

Keine. Empfohlen werden Grundkenntnisse im Umfang des Moduls Einführung in die Informatik. Biologische Grundlagen werden rekapituliert, entsprechende Vorkenntnisse daher nicht vorausgesetzt.


Verwendbarkeit

Importmodul aus dem M.Sc. Informatik.

Es kann im FB12 verwendet werden im Studiengang bzw. in den Studiengängen

  • B.Sc. Data Science
  • B.Sc. Informatik
  • M.Sc. Data Science
  • M.Sc. Informatik
  • M.Sc. Mathematik

Im Studiengang B.Sc. Informatik kann das Modul im Studienbereich Informatik Wahlpflichtmodule absolviert werden.

Die Wahlmöglichkeit des Moduls ist dadurch beschränkt, dass es der Praktischen Informatik zugeordnet ist.


Literatur

  • - J. Xiong. Essential Bioinformatics. Cambridge University Press, 2006.
  • - W. W. Cohen. A Computer Scientist’s Guide to Cell Biology. Springer-Verlag, 2007.
  • - N. Cristianini, M.W. Hahn. Introduction to Computational Genomics – A case studies approach. Cambridge press, 2007.
  • - F. J. Burkowski. Structural Bioinformatics – An algorithmic approach. Chapman & Hall, CRC, 2009..



Bitte beachten Sie:

Diese Seite beschreibt ein Modul gemäß dem im Wintersemester 2018/19 aktuellsten gültigen Modulhandbuch. Die meisten für ein Modul gültigen Regeln werden nicht durch die Prüfungsordnung festgelegt, und können daher von Semester zu Semester aktualisiert werden. Folgende Versionen liegen im Online-Modulhandbuch vor:

Das Modulhandbuch enthält alle Module, unabhängig vom aktuellen Veranstaltungsangebot, vergleichen Sie dazu bitte das aktuelle Vorlesungsverzeichnis in Marvin.

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