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CS 594 — Algorithmische Bioinformatik
(engl. Algorithms in Bioinformatics)

Niveaustufe, Verpflichtungsgrad Vertiefungsmodul, Wahlpflichtmodul
Lehr- und Lernformen,
Arbeitsaufwand		 Vorlesung (2 SWS), Übung (2 SWS),
180 Stunden (60 Std. Präsenzzeit, 120 Std. Selbststudium)
Leistungspunkte,
Voraussetzungen zum Erwerb		 6 LP
Studienleistung(en): Erreichen von mindestens 50 Prozent der Punkte aus den wöchentlich zu bearbeitenden Übungsaufgaben und mündliche Präsentation der Lösung von mindestens zwei der Übungsaufgaben.
Prüfungsleistung: Klausur oder mündliche Prüfung (Einzelprüfung)
Sprache,
Benotung		 Englisch,
Die Benotung erfolgt mit 0 bis 15 Punkten gemäß der Prüfungsordnung für den Studiengang M.Sc. Informatik.
Dauer des Moduls,
Häufigkeit		 Ein Semester,
Regelmäßig alle 2 Semester
Modulverantwortliche(r) Prof. Dr. Dominik Heider

Inhalt

  • Biologische Grundlagen
  • DNA-Analyse und Gen-Detektion
  • Microarray Techniken und -Analyse
  • Visualisierung und Dimensionsreduktion
  • Gene Ontologien
  • Überrepräsentationsanalyse
  • Micro-RNAs und ihre Funktionen
  • Wissensentdeckung in biologischen Wissensbasen

Qualifikationsziele

Die Studierenden

  • verstehen grundlegende Fragestellungen und Ziele in der Bioinformatik,
  • kennen grundlegende Konzepte der Modellierung von DNA und Proteinen,
  • haben Kenntnisse zu algorithmischen Grundlagen bioinformatischer Anwendungen,
  • verstehen Methoden der Wissensentdeckung in Biologischen Datenbanken und können diese anwenden,
  • sind in der Lage, wissenschaftliche Arbeitsweisen beim eigenständigen Erkennen, Formulieren und Lösen von Problemen anzuwenden,
  • sind in der Lage über wissenschaftliche Inhalte frei zu sprechen, sowohl vor einem Publikum als auch in einer Diskussion.

Voraussetzungen

Keine. Empfohlen werden Grundkenntnisse im Umfang des Moduls Einführung in die Informatik. Biologische Grundlagen werden rekapituliert, entsprechende Vorkenntnisse daher nicht vorausgesetzt.


Verwendbarkeit

Importmodul aus dem M.Sc. Informatik.

Es kann im FB12 verwendet werden im Studiengang bzw. in den Studiengängen

  • B.Sc. Data Science
  • B.Sc. Informatik
  • M.Sc. Data Science
  • M.Sc. Informatik
  • M.Sc. Mathematik

Im Studiengang B.Sc. Data Science kann das Modul im Studienbereich Freie Wahlpflichtmodule absolviert werden.

Das Modul ist der Informatik zugeordnet. Weitere Informationen zur Wählbarkeit sind der Bereichsbeschreibung zu entnehmen.


Literatur

  • J. Xiong. Essential Bioinformatics. Cambridge University Press, 2006.
  • W. W. Cohen. A Computer Scientist’s Guide to Cell Biology. Springer-Verlag, 2007.
  • N. Cristianini, M.W. Hahn. Introduction to Computational Genomics – A case studies approach. Cambridge press, 2007.
  • F. J. Burkowski. Structural Bioinformatics – An algorithmic approach. Chapman & Hall, CRC, 2009..



Bitte beachten Sie:

Diese Seite beschreibt ein Modul gemäß dem im Wintersemester 2023/24 aktuellsten gültigen Modulhandbuch. Die meisten für ein Modul gültigen Regeln werden nicht durch die Prüfungsordnung festgelegt, und können daher von Semester zu Semester aktualisiert werden. Folgende Versionen liegen im Online-Modulhandbuch vor:

Das Modulhandbuch enthält alle Module, unabhängig vom aktuellen Veranstaltungsangebot, vergleichen Sie dazu bitte das aktuelle Vorlesungsverzeichnis in Marvin.

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