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CS 594 — Algorithmische Bioinformatik
(engl. Algorithms in Bioinformatics)
Niveaustufe, Verpflichtungsgrad | Vertiefungsmodul, abhängig vom importierenden Studiengang |
Lehr- und Lernformen, Arbeitsaufwand |
Vorlesung (2 SWS), Übung (2 SWS), 180 Stunden (60 Std. Präsenzzeit, 120 Std. Selbststudium) |
Leistungspunkte, Voraussetzungen zum Erwerb |
6 LP Studienleistung(en): Erreichen von mindestens 50 Prozent der Punkte aus den wöchentlich zu bearbeitenden Übungsaufgaben und mündliche Präsentation der Lösung von mindestens zwei der Übungsaufgaben. Prüfungsleistung: Klausur oder mündliche Prüfung (Einzelprüfung) |
Sprache, Benotung |
Englisch,Die Benotung erfolgt mit 0 bis 15 Punkten gemäß der Prüfungsordnung für den Studiengang M.Sc. Informatik. |
Exportfach, Ursprung | Informatik, M.Sc. Informatik |
Dauer des Moduls, Häufigkeit |
Ein Semester, Regelmäßig alle 2 Semester |
Modulverantwortliche(r) | Prof. Dr. Dominik Heider |
Inhalt
- Biologische Grundlagen
- DNA-Analyse und Gen-Detektion
- Microarray Techniken und -Analyse
- Visualisierung und Dimensionsreduktion
- Gene Ontologien
- Überrepräsentationsanalyse
- Micro-RNAs und ihre Funktionen
- Wissensentdeckung in biologischen Wissensbasen
Qualifikationsziele
Die Studierenden
- verstehen grundlegende Fragestellungen und Ziele in der Bioinformatik,
- kennen grundlegende Konzepte der Modellierung von DNA und Proteinen,
- haben Kenntnisse zu algorithmischen Grundlagen bioinformatischer Anwendungen,
- verstehen Methoden der Wissensentdeckung in Biologischen Datenbanken und können diese anwenden,
- sind in der Lage, wissenschaftliche Arbeitsweisen beim eigenständigen Erkennen, Formulieren und Lösen von Problemen anzuwenden,
- sind in der Lage über wissenschaftliche Inhalte frei zu sprechen, sowohl vor einem Publikum als auch in einer Diskussion.
Voraussetzungen
Keine. Empfohlen werden Grundkenntnisse im Umfang des Moduls Einführung in die Informatik. Biologische Grundlagen werden rekapituliert, entsprechende Vorkenntnisse daher nicht vorausgesetzt.
Literatur
- J. Xiong. Essential Bioinformatics. Cambridge University Press, 2006.
- W. W. Cohen. A Computer Scientist’s Guide to Cell Biology. Springer-Verlag, 2007.
- N. Cristianini, M.W. Hahn. Introduction to Computational Genomics – A case studies approach. Cambridge press, 2007.
- F. J. Burkowski. Structural Bioinformatics – An algorithmic approach. Chapman & Hall, CRC, 2009..
Bitte beachten Sie:
Diese Seite beschreibt ein Modul gemäß dem im Wintersemester 2023/24 aktuellsten gültigen Modulhandbuch. Die meisten für ein Modul gültigen Regeln werden nicht durch die Prüfungsordnung festgelegt, und können daher von Semester zu Semester aktualisiert werden. Folgende Versionen liegen im Online-Modulhandbuch vor:
- WiSe 2016/17
- SoSe 2018
- WiSe 2018/19
- WiSe 2019/20
- WiSe 2020/21
- SoSe 2021
- WiSe 2021/22
- WiSe 2022/23
- WiSe 2023/24
Das Modulhandbuch enthält alle Module, unabhängig vom aktuellen Veranstaltungsangebot, vergleichen Sie dazu bitte das aktuelle Vorlesungsverzeichnis in Marvin.
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